Bajo la administración del Presidente Soto (1886), se fundó la primera escuela. Esta se construyó en el costado sur de la iglesia de la localidad.
En 1910, con el terremoto de Cartago, se derrumbó la pequeña institución. Después de este fenómeno natural, las clases comenzaron a impartirse en la casa del señor José Fernández, a quien se le conoció como “don Pepe” Fernández situada diagonal a la esquina noroeste de la iglesia, hoy Centro de nutrición y salud. Meses después el señor “Pepe” Fernández construyó en el mismo lugar una escuela con tres aulas. A esta escuela se le llamó Escuela Pepe Fernández, en agradecimiento por su colaboración.
De 1920 a 1929, la matrícula ascendió de trece a diecisiete alumnos por sección. Destaca el insigne educador de música don Luis Valle, quien compuso la música del himno de la institución, cuya letra pertenece a don Julián Marchena.
En la década de los treinta, bajo la administración de don Ricardo Jiménez, se levantó un tercer edificio. Con el transcurso de los años, esta construcción se volvió insuficiente para admitir mayor población estudiantil. La señora Rosa Barquero donó un terreno de 500 metros para el nuevo centro escolar, donde hoy se ubica, inaugurada el nueve de setiembre de 1935. La construcción de esta nueva escuela fue solicitada por la Junta de Educación al Ministerio de Fomento. Don León Cortes Castro, prestó atención a este llamado, por lo que le dieron su nombre al centro educativo.
Desde el año 1970 en adelante la matrícula aumentó considerablemente, por lo que se vio la necesidad de construir más aulas, para educación prescolar, apoyos educativos, laboratorio de cómputo, biblioteca, comedores amplios y un salón multiuso.
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